Dekontaminointi on puhdistusmenetelmä joka poistaa kaikki homeet, hiivat, bakteerit ja virukset. Näin pumppuun ei jää esimerkiksi homeitiöitä, jotka voisivat lähteä suodattimissa tai muualla kasvamaan, aiheuttaen huonoa sisäilmaa.
Kunnollinen ja oikein tehty puhdistus säännöllisesti suoritettuna takaa laitteen pitkäikäisyyden, sekä puhtaan ja hyvän sisäilmanlaadun. Puhdistushuolto kestää noin 1h.
Peruspuhdistus tulisi tehdä 2 kertaa vuodessa: ennen lämmityskautta ja ennen viilennyskautta (imurointi ja deko ), syväpuhdistus tulisi tehdä 2–4 vuoden välein (pesu ja dekontaminaatio).